近年来深圳已基本建成了集装箱枢纽港、华南地区航空门户机场和亚太地区重要的物流枢纽城市。深圳物流的运行效率全国，已经接近全球中等发达国家的物流运行水平，截至2010年，深圳市物流企业增加值达到900亿元，占GDP比重为9.67%，同比增长14.07%。为了推动深圳现代物流业的持续快速发展，增强物流业对深圳经济增长的拉动作用，深圳海关不断改革创新，努力推动深圳发展建设成为一个国际性物流枢纽城市。
保税物流是现代物流产业发展的一种新兴形态。深圳海关支持企业在保税区、出口加工区等特殊监管区域拓展保税物流功能，满足了即时生产、零库存、网上订货等新型生产、运输和经营方式的需求。深圳海关还在支持下鼓励和引导企业在海关特殊监管区域和保税监管场所内设立高端产品研发中心、检测维修服务中心并开展仓储、配送、分拨等物流服务，以此延长产业链，提高附加值，有效地帮助企业降低经营成本。
据介绍，近年来，深圳海关一直大力配合深圳特殊监管区域建设。从全国个保税区——沙头角保税区，到随后的出口加工区、保税物流园区、出口监管仓库，再到目前开放程度、功能全、政策便利的保税港区，深圳海关不断从政策咨询、设计规划、功能优化等方面给予支持，努力促进培育深圳新的经济增长点。目前，深圳现有的海关特殊监管区域包括3个保税区、1个保税物流园区、2个出口加工区、1个保税港区；保税监管场所包括27个保税仓库、35个出口监管仓库以及1个保税物流中心。

综合保税区具备保税仓储、国际贸易、国际分拨、国际中转、检测维修、保税展示、研发制造、港口作业等多种功能，综合保税区享受保税区、出口加工区相关的税收和外汇管理政策，包括境外货物入区保税，国内货物入区视同出口实行退税，区内企业之间的货物交易不征增值税和消费税等。 综合保税区可完全对接自贸试验区，未来可开展跨境电子商务、保税展示交易、检测维修等各种新兴业态。深圳盐田综合保税区将成为推动深圳特殊监管区域转型升级的新引擎，为经济高质稳定增长注入新活力。

为推动地方物流产业发展，深圳海关措施不断。具体包括：积极协调跟进ＵＰＳ亚洲转运中心落户深圳并运行工作，提供一站式服务、24小时通关和深港跨境快速通关等一系列通关便利；推动机场Ｂ型保税物流中心通过验收并正式监管营运，实现365天×24小时货物通关和跨境快速通关；支持盐田综合保税区的申报工作，推动盐田保税物流园、盐田保税区、沙头角保税区和盐田港[6.48 0.00%]后方陆地整合工作；支持前海湾保税港区内企业开展国际采购、配送、集拼分拨等现代物流业务，促进保税港区口岸、加工、物流等业务功能延伸；在部分特殊监管区内开展检测和出口产品售后维修试点，并优化和完善海关有关监管模式；支持企业在出口加工区内开展研发试点及在福田保税区开展检测维修业务。


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